2025年，沉睡在北极冰层下的远古巨人突然苏醒，身高百米的巨兽踏碎城市，人类文明面临灭顶之灾。生物学家陈峰发现巨人细胞具有自我修复能力，但每次修复都会加速其进化。军方试图用核弹摧毁巨人，却反而使其分裂成三个更强大的个体。陈峰与女军官林薇合作，利用巨人的声波弱点，研制出高频共振武器。最终决战中，巨人的意识与人类产生了某种共鸣，揭示了巨人是地球免疫系统的化身——为清除过度破坏环境的人类而诞生。陈峰选择与巨人意识融合，用自己的生命重置了巨人的指令，使它们重新陷入沉睡。人类获得了第二次机会，但警钟已敲响。